V navazujícím magisterském stupni náš ústav zajišťuje výuku v jedenácti předmětech studijních programů Stavební inženýrství (v přehledu předmětů označeno „SI“) a Geodézie a kartografie (v přehledu předmětů označeno „GK“).
NNA009 Železniční konstrukce 1 (SI)
NNA008 Geografické informační systémy (SI)
NNB014 Železniční konstrukce 2 (SI)
NNB015 Železniční stanice (SI)
BNA007 Vybrané statě ze železničních staveb 1 (DST) (SI)
NNB011 Diplomový seminář (K-ZEL) (SI)
NNB013 Vybrané statě ze železničních staveb 2 (SI)
NNB010 Železniční stanice a uzly 1 (DST) (SI)
NNB012 Vybrané problémy z dopravního inženýrství (SI)
NNB016 Železniční stanice a uzly 2 (SI)